Dwa niepowiązane badania prowadzą do odkrycia inhibitorów CRISPR-Cas12a

Polska Akademia Nauk i ja prosimy Was o pomoc (Lipiec 2019).

Anonim

Dwa zespoły pracujące niezależnie od siebie zidentyfikowały kilka inhibitorów CRISPR-Cas12a. Pierwszy zespół składał się z członków z Uniwersytetu Kalifornijskiego w Berkeley, drugi miał członków Massachusetts General Hospital i University of California. Obaj wykorzystali narzędzia bioinformatyczne do skanowania genomów bakterii pod kątem możliwych inhibitorów i obaj opublikowali swoje wyniki w czasopiśmie Science.

CRISPR to technika edycji genów, która może identyfikować segmenty DNA i wycinać je z genomu. Można go również wykorzystać do zastąpienia wyciętych segmentów. Aby wykonać swoje obowiązki, CRISPR wykorzystuje nukleazę białkową, aby służyć jako przewodnik lub szablon, określający, które geny mają zostać pocięte i / lub wymienione. Cas9, często używany do tego celu w wielu wczesnych badaniach, zaczął być związany z tą techniką. Aby Cas9 działał poprawnie, naukowcy musieli dodać inhibitor Cas9 - jego zadaniem było zapobieganie obcemu cięciu. Niedawno naukowcy zastosowali Cas12a, ponieważ oferuje on inne pożądane cechy, które nie występują w Cas9. Ale do tej pory nie było znanych inhibitorów Cas12a, co utrudniało jego wykorzystanie w wysiłkach badawczych. W tych dwóch nowych próbach oba zespoły znalazły kilka inhibitorów, które według nich są odpowiednie do użycia z CRISPR.

Oba zespoły zastosowały podejście do bioinformatyki w poszukiwaniu inhibitorów Cas12 - jest to system do przeszukiwania genomów bakteryjnych, który polega na poszukiwaniu fragmentów genetycznych, które są zwykle śmiertelne dla bakterii, ale nie są skierowane przeciwko bakteriom, które mają inhibitory. Korzystając z tego podejścia, pierwszy zespół znalazł trzy inhibitory, w tym jeden wyróżniający się nazwany AcrVA1. Testowanie z użyciem ludzkich komórek wykazało, że wszystkie trzy mogłyby być stosowane z CRISPR. Używając tego samego podstawowego podejścia, drugi zespół znalazł kilku kandydatów, którzy również pracowali zgodnie z oczekiwaniami podczas testów z komórkami ludzkimi. Drugi zespół stwierdził również, że AcrVA1 jest szczególnie skuteczny.

Podsumowując, praca obu zespołów przyniosła kilka możliwych inhibitorów Cas12a, z których jedno wydaje się szczególnie obiecujące. A to może prowadzić do bardziej owocnych badań przy użyciu CRISPR-Cas12a jako nowego narzędzia do edycji genów.

menu
menu